중대재해 처벌법은 피해자가 근로자일 경우 중대 산업 재해, 시민일 경우 중대 시민 재해로 구분된다. 이번 사고는 승객과 승무원이 다친 사건으로 두 재해 모두에 해당한다. 전문가들은 이 사고가 중대재해 처벌법 적용 대상임에 동의하지만, 법 적용 대상이라고 모두 처벌되는 것은 아니다. 중대 시민 재해는 항공안전법, 중대 산업재해는 산업 안전법에 따라 책임자가 안전 의무와 관리상 조치를 이행하지 않았을 경우에만 처벌된다. 따라서 사고의 명확한 원인 규명이 우선되어야 한다. 만약 조사 결과 기체 결함이 직접적인 원인이라면, 제주항공 대표도 처벌 대상이 될 수 있다. 2023년 국토교통부의 해설서에 따르면, 기체 결함으로 인한 사고 시 항공사 대표에게 중대재해 처벌법 위반으로 징역 1년 이상이나 10억 원 이하의 벌금이 부과될 수 있다. 외부적 불가항력적 요인으로 인한 사고는 처벌되지 않지만, 기계적 결함이나 관리 부주의가 원인이라면 책임자가 처벌받을 가능성이 있다. 또한, 사고 원인이 공항 시설 때문이라면 한국공항공사도 처벌 대상이 될 수 있다.